Prezident pri informovaní o tom, že Kuffu zatiaľ nevymenuje za ministra, argumentoval podozreniami z trestných činov. Hlava štátu pripomenula, že už niekoľko týždňov v mediálnom priestore zaznievajú informácie, ktoré naznačujú možnosť nekalého konania niektorej z organizácií ministerstva životného prostredia či prípadného nehospodárneho nakladania s majetkom SR.

Pellegrini sa preto obrátil na príslušné štátne orgány, ktoré môžu prezidentovi zo zákona poskytnúť informácie o tom, či uvedené medializované informácie sú, alebo nie sú predmetom činnosti orgánov činných v trestnom konaní. Podľa jeho slov mu bolo potvrdené, že pri medializovaných informáciách a uvedených podozreniach sa začalo viesť trestné stíhanie pre podozrenie zo spáchania viacerých trestných činov, napríklad machinácií pri verejnom obstarávaní a verejnej dražbe, porušovania povinností pri správe cudzieho majetku, legalizácii výnosov z trestnej činnosti, ako aj možného zneužívania právomoci verejného činiteľa.

"Rešpektujúc prezumpciu neviny a netušiac, ako môže nakoniec toto trestné stíhanie dopadnúť, nemôžeme v tejto chvíli ani vylúčiť, že s vysokou pravdepodobnosťou môže toto trestné stíhanie súvisieť sčasti aj s výkonom funkcie terajšieho štátneho tajomníka Filipa Kuffu," uviedol vtedy Pellegrini s tým, že keďže nie je možné vylúčiť, že toto trestné stíhanie môže časom dospieť aj k obvineniu tejto osoby, požiadal premiéra o prehodnotenie tejto nominácie aj o predloženie nového návrhu na vymenovanie člena vlády.

Tomáš Taraba bol odvolaný z postu ministra po tom, ako mu v utorok 29. septembra poslanci Národnej rady SR vyslovili nedôveru.